Cadrul legal de organizare și funcționare a învățământului superior este descris în Codul Educației al Republicii Moldova.

Învățământul superior este un factor-cheie pentru dezvoltarea culturală, economică și socială a societății bazate tot mai mult pe cunoaștere și un promotor al drepturilor omului, dezvoltării durabile, democrației, păcii și justiției.

Instituțiile de învățământ superior dispun de statut de autonomie universitară: libertăți academice fără niciun fel de interferență ideologică, politică sau religioasă. Ele sunt autonome în domeniile conducerii, structurării și funcționării instituției, activității didactice și de cercetare științifică, administrării și finanțării.

Carta universitară stabilește misiunea, principiile academice, obiectivele, structura și organizarea instituției de învățământ superior.

Învățământul superior se bazează pe standarde de calificare și acreditare:

• Standardele de calificare se elaborează și se aprobă de către Ministerul Educației și Cercetării al Republicii Moldova. Cadrul Național al Calificărilor este implementat în Republica Moldova începând cu anul 2017 și este corelat cu Cadrul European al Calificărilor.

• Standardele de acreditare se elaborează de către Agenția Națională de Asigurare a Calității în Educație și Cercetare (ANACEC), se coordonează cu ministerele de resort și se aprobă de Guvern.

Sistemul de asigurare a calității instituțiilor de învățământ superior prevede două etape succesive:

• Autorizarea de funcționare provizorie

• Acreditarea.

Orice instituție publică sau privată, interesată să ofere programe de studii superioare, trebuie să se supună procesului de evaluare externă, în vederea autorizării de funcționare provizorie, înainte de a începe să activeze. Autorizarea de funcționare provizorie a programelor de studii din învățământul superior expiră după prima promoție de absolvenți. Apoi, instituția trebuie să se supună procesului de evaluare externă, în vederea acreditării. 

Atât instituția de învățământ superior, cât și programele de studii sunt supuse acreditării. După obținerea acreditării, programele de studii și instituțiile de învățământ superior sunt supuse unei evaluări externe periodice, în vederea reacreditării, cel puțin o dată la 5 ani.

O instituție de învățământ superior acreditată pentru un program de master poate oferi și alte programe de master în același domeniu profesional, după aprobarea acestora de către senatul instituției. În acest caz, nu este necesară o evaluare externă pentru autorizarea provizorie. Aceste programe de master sunt considerate autorizate să funcționeze provizoriu în același domeniu profesional, dar rămân supuse tuturor procedurilor de acreditare.

Acreditarea (evaluarea externă a calității) în învățământul superior se realizează de către Agenția Națională de Asigurare a Calității în Educație și Cercetare (ANACEC) sau o altă agenție de evaluare a calității, înregistrată în Registrul European pentru Asigurarea Calității.

Decizia privind autorizarea de funcționare provizorie sau acreditarea se adoptă de către Ministerul Educației și Cercetării, în baza rezultatelor evaluării efectuate de agenția de evaluare a calității.

Strategia de Dezvoltare „Educația 2030” stabilește 9 obiective strategice:

• Educație de calitate pentru dezvoltare durabilă

• Educație incluzivă pentru o societate incluzivă

• Cadre didactice calificate pentru educație de calitate

• Societatea, comunitatea și familia pentru educație de calitate

• Medii de învățare eficiente și motivante

• Tehnologii informaționale și comunicaționale moderne pentru asigurarea calității și sustenabilității educației

• Învățarea și educația adulților pentru calitatea vieții

• Cercetare științifică relevantă pentru inovații și calitate în educație

• Buna guvernare și infrastructură modernă pentru educație de calitate 

Sistemul de învățământ superior din Moldova face parte din procesul Bologna din 2005 și este organizat în 3 cicluri, pe niveluri ale Clasificării Internaționale Standard a Învățământului (ISCED):

• Ciclul I - Licență (nivel ISCED 6);

• Ciclul II - Master (nivel ISCED 7);

• Ciclul III - Doctorat (nivel ISCED 8).

Studiile superioare integrate (ciclurile I și II) sunt organizate în domeniile medicină, farmacie și stomatologie; medicină veterinară; arhitectură.

Învățământul superior se realizează pe două filiere: academică și profesională avansată.

Organizarea anului universitar:

Anul universitar cuprinde două semestre, care includ două sesiuni de examene, stagiile de practică și două vacanțe. Un semestru are o durată medie de 15 săptămâni. Structura și durata sesiunilor de examene, precum și durata vacanțelor, sunt stabilite de instituția de învățământ superior.

Pe parcursul ciclurilor I și II de studii superioare (licență și master) studentul trebuie să acumuleze cel puțin 300 de credite de studii (ECTS):

• pentru un semestru academic – minim 30 de credite ECTS;

• pentru un an universitar – minim 60 de credite ECTS.

Instituțiile de învățământ superior pot accepta maximum 60 de credite ECTS acumulate în învățământul profesional tehnic postsecundar nonterțiar (nivel ISCED 5).

Studiile superioare de licență, master și doctorat sunt organizate în următoarele forme de învățământ:

• cu frecventa;

• cu frecvență redusă;

• la distanta.

În cazul învățământului cu frecvență redusă și la distanță, durata studiilor este mai mare cu un an decât în învățământul cu frecvență. Numărul de credite ECTS și conținutul programului de licență sunt aceleași pentru toate formele de învățământ (cu frecvență redusă și la distanță). Numărul total de credite ECTS este distribuit proporțional pe ani și semestre de studii.

Studiile superioare integrate (ciclurile I și II) se organizează doar în format cu frecvență.