Vysokú školu riadi, zastupuje a koná v jej mene rektor vysokej školy spolu s vedúcimi zamestnancami vysokej školy.  Vedúcimi zamestnancami verejnej vysokej školy sú kvestor a jednotliví vedúci súčastí verejnej vysokej školy. Ich činnosť a kompetencie upravuje zákon o vysokých školách.

Ak sa vysoká škola člení na fakulty, vykonávajú fakulty samosprávnu pôsobnosť  rozsahu určenom vnútorným poriadkom vysokej školy.

Požiadavky na menovanie

Rektor je štatutárnym orgánom verejnej vysokej školy, riadi ju, koná v jej mene a zastupuje ju navonok. 

Rektora vymenúva a odvoláva na návrh akademického senátu verejnej vysokej školy Prezident Slovenskej republiky. Návrh akademického senátu verejnej vysokej školy predkladá prezidentovi republiky Minister školstva, výskumu, vývoja a mládeže SR. 

Právo navrhovať najviac jedného uchádzača o kandidatúru na funkciu rektora má každý člen akademickej obce. Kandidát sa môže uchádzať o kandidatúru na funkciu rektora aj sám. Kandidátom môže byť len člen akademickej obce príslušnej vysokej školy s kvalifikáciou vysokoškolského učiteľa. Návrhy kandidáta na rektora sa podávajú neanonymne, v písomnej forme. 

V prípade súkromných vysokých škôl rektora vyberá vlastník, v prípade štátny vysokých škôl je výber rektora v kompetencii príslušného ministerstva.

Prorektorov zatupuje rektora v ním určenom rozsahu. Prorektorov vymenúva a odvoláva po schválení akademickým senátom rektor. Funkčné obdobie prorektorov je štvorročné 

Verejná vysoká škola sa môže členiť na fakulty, iné pedagogické, výskumné, vývojové, umelecké, hospodársko-správne a informačné pracoviská (univerzitná knižnica) a účelové zariadenia (vysokoškolské internáty). 

Vedúcimi zamestnancami verejnej vysokej školy sú kvestor a jednotliví vedúci súčastí verejnej vysokej školy podľa. Funkcie vedúcich zamestnancov verejnej vysokej školy sa obsadzujú výberovým konaním. Zásady výberového konania na funkcie vedúcich zamestnancov verejnej vysokej školy určí vnútorný predpis verejnej vysokej školy. 

Kvestor zabezpečuje a zodpovedá za hospodársky a administratívny chod verejnej vysokej školy a koná v jej mene v rozsahu určenom rektorom. Je podriadený priamo rektorovi.

Dekan je predstaviteľom fakulty, riadi ju, zastupuje a koná vo veciach fakulty. Dekana vymenúva a odvoláva na návrh akademického senátu fakulty rektor. Funkčné obdobie dekana je štvorročné. Na jednej fakulte môže tá istá osoba vykonávať funkciu dekana najviac v troch po sebe nasledujúcich funkčných obdobiach.

Dekana zastupujú v ním určenom rozsahu prodekani. Prodekanov vymenúva a odvoláva po schválení akademickým senátom fakulty dekan. Funkčné obdobie prodekanov je štvorročné.

Vedúcimi zamestnancami fakulty sú tajomník fakulty a jednotliví vedúci pedagogických, výskumných, vývojových alebo umeleckých, hospodársko-správnych a informačných pracovísk a účelových zariadení fakulty. Funkcie vedúcich zamestnancov fakulty sa obsadzujú výberovým konaním. Spôsob výberového konania na funkcie vedúcich zamestnancov fakulty určí pracovný poriadok fakulty alebo pracovný poriadok verejnej vysokej školy, ak sa ním fakulta riadi.

Tajomník fakulty zabezpečuje hospodársky a administratívny chod fakulty. Je podriadený priamo dekanovi.

Podmienky služby

Pracovné podmienky riadiacich pracovníkov vysokej školy a jej súčastí sa riadia zákonníkom práce a vnútornými predpismi vysokej školy. 

Dĺžka týždenného pracovného času je stanovená v súlade s ustanoveniami § 85 Zákonníka práce, v prípade akademických pracovníkov aj zákonom o vysokých školách a v súlade s kolektívnou zmluvou. Pracovná doba je upravená v interných predpisoch školy, pričom zohľadňuje potreby riadenia vysokej školy.

Rektor a dekan sú volení do funkcie z radov vysokoškolských učiteľov a majú nárok na dovolenku v trvaní 8 týždňov. Pre viac informácií pozri kapitolu Podmienky služby pre akademických zamestnancov vysokých škôl.

Platové podmienky rektora stanovuje správna rada vysokej školy. 

Rektor určuje plat dekanov fakúlt, ktoré sú súčasťou verejnej vysokej školy.