Posebnosti u srednjim školama 

U gimnazijama i strukovnim školama postoje sportski odjeli. Sportske odjele u gimnazijama i strukovnim školama upisuju učenici koji se aktivno bave sportom i postižu iznimne uspjehe. Osim u  Sportsku gimnaziju u Zagrebu učenici se mogu upisati i u druge srednje škole koje imaju sportske razredne odjele. Posebnost organizacije rada i izvođenja nastave u sportskim razrednim odjelima je u prilagođenosti izvođenja nastave specifičnim potrebama učenika sportaša.

Sukladno Pravilniku o elementima i kriterijima za izbor kandidata za upis u I. razred srednje škole, pravo prijave za upis u razredne odjele za sportaše ima kandidat koji je uvršten na rang listu određenoga nacionalnoga sportskoga saveza. Nacionalni sportski savezi provode rangiranje prijavljenih kandidata na temelju kriterija sportske uspješnosti. Kriterije sportske uspješnosti za svaki pojedini sport autonomno utvrđuju odgovarajući nacionalni sportski savezi te ih objavljuju na svojim mrežnim stranicama i dostavljaju Središnjem državnom uredu za šport. Konačna ljestvica poretka kandidata utvrđuje se zbrajanjem bodova dobivenih prema kriterijima sportske uspješnosti te zajedničkog, dodatnog i posebnog elementa vrednovanja.

U srednjim školama se dio nastavnih predmeta i sadržaja utvrđenih nastavnim planom i programom ili kurikulumom, osim na hrvatskom jeziku, može izvoditi i na nekom od svjetskih jezika, sukladno Pravilniku o izvođenju nastave dijela nastavnih predmeta i sadržaja utvrđenih nastavnim planom i programom na nekom od svjetskih jezika u srednjoj školi (NN 116/16).

• Međunarodni programi
• International Baccalaureate(IB) je općeobrazovni program koji u dvije cjeline obuhvaća cjelokupnu srednju školu u trajanju od četiri godine: (1) Midlle Years Programme (IBMYP) koji se ostvaruje u prvom i drugom razredu i (2) Diploma Programme (IBDP) koji se ostvaruje u trećem i četvrtom razredu. Nastava u međunarodnom programu izvodi se na engleskom jeziku. Upis u ove programe regulira svaka škola sama za sebe. Školovanje se plaća.
• Njemačka međunarodna škola u Zagrebu - Deutsche Internationale Schule in Zagreb, nastavu održava po programu Savezne Republike Njemačke i Središnjega ureda za školstvo u inozemstvu (ZfA) na njemačkom jeziku i to osnovnoškolski  (Grundschule) program (I. do IV. razred) i gimnazijski (Gymnasium) program (V. do XII. razred).
• The British International School u suradnji s Cambridge International Examinations u kojoj se nastava izvodi na engleskome jeziku, a prema britanskom nacionalnom kurikulumu.
• Američka  međunarodna škola u Zagrebu – American International School of Zagreb,  osnovana je na temelju Sporazuma između Vlade Republike Hrvatske i Vlade Sjedinjenih Američkih Država. Škola pruža obrazovanje na engleskom jeziku djeci u dobi od tri do 18 godina prema akreditiran programu International Baccalaureate Organization.

Osim javnih škola, u sustavu srednjoškolskog obrazovanja djeluje 16 vjerskih te 18 privatnih srednjih škola s gimnazijskim programom s pravom javnosti u kojima se izvodi nastava u skladu s nacionalnim kurikulumom i nastavnim planovima i programima za srednju školu koje je donijelo ministarstvo nadležno za obrazovanje.

Za učenike koji zbog većih motoričkih teškoća ili kroničnih bolesti ne mogu polaziti nastavu, škola uz odobrenje ministarstva nadležnog za obrazovanje organizira nastavu u kući, odnosno zdravstvenoj ustanovi ako se učenik nalazi na dužem liječenju te omogućava polaganje predmetnog ili razrednog ispita. Ova vrsta nastave može se provoditi u obliku nastave na daljinu (virtualna nastava), korištenjem sredstava elektroničke komunikacije. Škola u okviru raspoloživih sredstava osigurava tim učenicima, odgovarajuća pomagala za provođenje nastave na daljinu.

Posebni programi u strukovnim školama 

Odgoj i obrazovanje darovite djece i učenika

Posebni programi za učenike s teškoćama u razvoju